比较通用的方法是TCP窗口

你抓取对方的TCP连接数据包，然后给双方发送无数据字段的ACK数据包，把TCP窗口设置的很小就是了，甚至可以用0字节的窗口让他们先休息一下。同时，使用pcap的统计功能计算对方的上下行速度，自己选择合适的时候发这些限速用的窗口包就是了。

当然实际应用中还有很多需要照顾到的细节，包括交换机欺骗等等。你慢慢调试吧。
在抓包方面无疑pypcap是最推荐的，python发包可以用 sendpkt ( http://sendpkt.googlecode.com/ )。

这里有一篇介绍sendpkt的帖子(http://gashero.yeax.com/?p=26)，至于pypcap的帖子很多。另外，dpkt是必须要学的。
至于udp限速则很困难，除非你做ARP欺骗，直接drop掉他的很多数据包，否则udp这么简陋的协议是没有流量控制的。