pt-duplicate-key-checker是Percona Toolkit中的一员，它通过扫描数据库中数据表的表结构定义，找出重复的索引，然后生成DROP INDEX的SQL语句。

使用实例如下：

pt-duplicate-key-checker -S /data/mysql/3306/mysql.sock

截取输出的一部分：

# id is a duplicate of PRIMARY
# Key definitions:
#   KEY `id` (`id`) USING BTREE
#   PRIMARY KEY (`id`),
# Column types:
#	  `id` int(11) not null auto_increment
# To remove this duplicate index, execute:
ALTER TABLE `okaybuy`.`p_supplier_adjust_apply` DROP INDEX `id`;

一般来说，所谓“重复的索引”，有以下几种情况：

1，索引列完全相同，只是索引的名字不同。例如：

key name_1(name),

key name_2(name)

2，多列索引前缀包含。例如：

key index_1(name,email,id),

key index_2(name)

3，一般索引与主键重复。例如：

primary key(id),

key  index_1(id)

4，一般索引与Unique索引重复。例如：

unique key(id),

primary key(id),

key index_1(id)

重复的索引对于查询速度没有改进，但对于写入速度会有严重影响，并且还占用磁盘空间，应当尽量避免。

参考文档：

http://www.mysqlperformanceblog.com/2012/06/20/find-and-remove-duplicate-indexes/

http://www.percona.com/doc/percona-toolkit/2.2/pt-duplicate-key-checker.html

http://www.percona.com/doc/percona-toolkit/2.2/